EKK on aloittanut uudelleen teologisen työskentelyn viime vuoden lopulla. Teologiseen työskentelyyn kuuluu kirkkojen missiologisen osaamisen vahvistaminen, kulttuurien ja uskontojen välinen dialogi sekä teologinen työskentely.
Teemat nousevat yhteistyöstä Kirkkojen maailmanneuvoston kanssa. EKK on mm mukana järjestämässä KMN:n opiskelijoille suunnattua tänä vuonna Berliinin kirkkopäivien yhteydessä.
Rauhantyö on liitetty teologiseen työskentelyyn. EKK muun muassa liittyy keskusteluun oikeutetusta rauhasta ja sodasta. Tämän päivän Euroopassa rauhantyö on erityisen tärkeää vastakkainasettelun vuoksi. Suunnitteilla on myös välimiestyöskentely konfliktitilanteissa. Teologista dialogia ja rauhantyötä koordinoi väitöskirjaansa lopetteleva kreikkalainen ortodoksiteologi Katerina Pekridou.