Nuorisojaosto koostuu jäsenkunnan nimeämistä nuorisoedustajista. Jaoston tehtävä on vahvistaa ekumeenisia yhteyksiä nuorten ja opiskelijoiden parissa. Jaoston yhteydessä toimii myös nuorille aikuisille suunnattu Kansainvälisen ja ekumeenisen toiminnan koulutusohjelma (Ketko).